2014年12月，國家食藥監管總局公布抽檢信息，其中瓶（桶）裝水等微生物污染問題仍較突出，學校開水機近800種瓶（桶）裝水被曝不合格，樂百氏、怡寶等品牌桶裝水均上不合格榜。

  2014年9月，在北京食品藥品監督管理局公布的19種不合格產品中，“怡寶”、“娃哈哈”等8個品牌的18.9升桶裝水均因檢出菌落總數超標被通報，其中“怡寶”超標準值1000多倍。2015年6月， 內蒙古食藥監局公布抽檢信息，瓶（桶）裝水樣品不合格率達10.5%。

  2015年5月，廣西食藥監局公布一季度抽檢信息，抽檢的289個批次的桶裝飲用水中，共有30個批次不合格，不合格率為10.4%。

  抽查發現，不合格項目主要為霉菌和酵母、菌落總數不合格，微生物污染問題十分突出。據介紹，菌落總數是指示性微生物，并非致病菌，主要用來評價食品清潔度。造成微生物指標不合格的主要原因有：

  一是部分企業存在管理不嚴、包裝容器和設備設施等清洗消毒不符合規定，生產條件不達標等情況；

  二是部分經營企業未按照相關要求存放大桶水，存在產品露天堆放或日光下曝曬等問題；

  三是有的大桶水包裝蓋密封不嚴，在運輸、流通環節中可能導致微生物污染等。

  北京市桶裝飲用水銷售行業協會調查數據顯示，目前北京水站超過萬家，其中正規水站僅占50%至60%。而北京日均消耗的桶裝水約為65萬桶，其中假水大約占總消耗量的1/6。“黑水廠”抽取井水經簡單過濾灌裝后，搖身一變成“知名品牌”桶裝水，出廠價不足2元，消費者購買價格卻達十余元。沒有經過任何衛生檢測，直接流向市場。業內人士稱，目前桶裝水市場價格混亂、真假摻雜，桶裝水配送站資質不全，存儲條件不達標，制售假水的水廠難以禁絕，且已成業內常態。

  長久以來，回料桶都是一個人盡皆知的“秘密”。一個水桶正常情況下可循環使用40次左右，使用周期在2到3年。 不過很多廠家都是無限制重復使用，這會導致桶內污染物聚集，污染水質。同時，有些企業在回收中并不甄別，致使許多已嚴重污染的桶被回收入庫。桶的清洗也至關重要。一般來說，桶的清洗要經過22道工序，內壁18道，外壁4道，以保證最大程度消滅水中的細菌。但是，多數中小企業在桶的清洗上自律不嚴格，清洗不徹底、清洗程序不規范的情況十分常見。水桶密封性也與桶裝水質量安全息息相關。桶裝水運輸歷經裝車、卸貨、水店存儲、送貨上門等過程，中途瓶蓋有可能因顛簸和碰撞而松動漏氣，極有可能受到空氣污染，產生致病菌。

  桶的材質也容易造成水質的污染。2003年以前，包裝桶多采用PET或者PC材質。PET質地較軟，容易附著可滲透的細菌、重金屬等，且長期使用或者加熱后會釋放致癌物質，對人體消化、神經系統有不同程度的損害，無法滿足循環利用要求；PC材質則耐熱、易于清洗，可反復使用。而PET材料成本只有PC材料的一半。

  在2003年后，國家出臺強制性政策，要求桶裝水生產廠家只能使用PC材質桶。但事實上，部分企業為了市場競爭，使用了PET材料替代PC材料，為桶裝水質量埋下隱患。為了降低成本，一些不法企業甚至將諸如醫用針頭、光盤類的廢棄垃圾經過粉碎處理后加入制桶原料。這類垃圾材料多半安全性較差，且含有毒有害物質，容易融入水中導致水體污染。

  飲水機二次污染，是指日常生活中使用飲水機而忽略飲水機本身的清潔和消毒造成飲用水的污染。一般飲水機在出水時，要有空氣進入水桶內形成負壓，才能保證出水順暢。空氣進入飲水機中，便會將細菌帶入，繼而造成對人體健康的危害，這就是飲水機的“二次污染”。

  飲水機如果長期不清洗，打開時就能看到內壁、出水口有一層淡土黃色的東西，用手一摸有黏滑感，這就是細菌生長繁殖時產生的污垢。廣東省環境資源利用與保護重點實驗室采樣檢測發現，在常溫條件下，飲水機里的水第一天有害菌落數量為0，而在第10天卻攀升到了8000。這證明桶裝水受二次污染相當嚴重。

  飲水機是利用空氣壓力原理工作的，取水的同時，等量的空氣也進入飲水機中。即便是清潔環境中，空氣中也有4000個/平方米的細菌，同時一氧化碳、煙霧毒物、飄塵及微生物，都會隨空氣帶入飲水機中，從而污染原純凈水。水體中的微生物，如藻類病菌等，經過一段時間的繁殖，會達到危害人體健康的濃度，導致飲水機二次污染。一桶水喝的時間越長，細菌繁殖的數字就越驚人，從而對人體健康造成嚴重危害。

  另外，學校開水機通常是桶裝水的桶頸倒過來后放在飲水機凸出的座上，然后由機內的軟管將水導入兩個水膽內，其中一個是熱水膽，一個是冷水膽，這兩個水膽除了起到出冷熱水的功能外，還可起到沉淀水中雜質的作用。人們通常不斷重復更換桶裝水，卻忽視了飲水機內膽還存有近1000毫升的水，這水中就會隱藏著致病細菌，久而久之便成了細菌滋生的溫床。此外，在飲水機中，水的加熱是通過內置的熱膽來完成的，正是這種內膽，讓飲水機久煮產生“千滾水”。飲用水在熱膽內經反復加熱后，會形成“千滾水”。這種水含有重金屬、砷化物等有害物質，久飲會危害胃腸健康。

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